Plusieurs logiciels permettent de comparer des séquences d'acides nucléiques (ADN ou ARN) :
GénieGen et Anagène permettent en outre de convertir les séquences nucléotidiques d'ADN en ARN et en séquences peptidiques.
| Action | Commande dans Anagène | Commande dans GénieGen | Commande dans ClustalX |
|---|---|---|---|
| Ouvrir une séquence | Fichier / Ouvrir | Fichier / Charger des séquences | File / Load Sequences |
| Écrire une séquence | Fichier / Créer… | Fichier / Entrée d’une séquence | - |
| Comparer des séquences | Traiter / Comparer les séquences… | Action / Alignement | Alignment / Do Complete Alignment (mode "Multiple Alignment"), enregistrer le fichier avec le suffixe "txt" puis l'ouvrir avec un ttx ou un navigateur |
| Transcrire une séquence | Traiter / Convertir les séquences… / ARN messager | Action / Transcription | - |
| Traduire une séquence | Traiter / Convertir les séquences… / Séquence peptidique | Action / Traduction | - |
| Digérer une séquence | Traiter /Action enzymatique | Action / Enzyme de restriction | - |