A11D1 Biodiversité TES

Si jamais aucun scientifique n'a déclaré que nous "descendions du singe", en revanche la ressemblance entre l'humain et les (autres) singes est frappante…

On cherche à déterminer, sur des critères morpho-anatomiques et génétiques, l'espèce la plus proche de l'humain.

Notions évoquées dans ce dossier

un primate
un grand singe
un lien de parenté
un arbre phylogénétique
un ancêtre commun
une innovation évolutive

Document 1 - Données morpho-anatomiques

Pour comprendre le principe de la classification par emboîtements et la notion d'arbre de parenté (ou arbre phylogénétique), commencez par ce petit jeu :

Maintenant que vous êtes prêts, vous allez utiliser un logiciel plus "sérieux", Phylogène.

Ouvrir le logiciel Phylogène ("Tous les programmes / SvT…). Choisir le menu "Configuration" et cocher la case "Seconde".
Sélectionner, dans la fenêtre déroulante "Sélectionner une collection", le dossier des espèces "Archontes (Primates)". Cliquer sur le bouton "OK".

Réalisation de la matrice de caractères

La matrice (ou tableau) de caractères permet de noter, pour chaque espèce choisie, les caractères morpho-anatomiques présents.

Choisir le menu "Activités / Construire".
Sélectionner les espèces étudiées dans le menu déroulant (sélectionner à nouveau une espèce pour la supprimer de la matrice). L'ordre n'a pas d'importance.
Sélectionner les caractères dans le menu déroulant (sélectionner à nouveau un caractère pour le supprimer de la matrice). L'ordre n'a pas d'importance.
Remplir les cases de la matrice en indiquant si le caractère est présent ou absent dans l'espèce considérée (clic droit de la souris). S'aider avec les informations données dans la fenêtre info (NB : vous n'avez pas à les retenir !). Rectifier d'éventuelles erreurs après avoir cliqué le bouton "Vérifier".

Construction des groupes emboîtés

Choisir le menu "Activités / Classer".
Cliquer sur le bouton "Afficher les boîtes".
Faire apparaître les boîtes (= groupes d'êtres vivant) en cliquant les caractères.

Déplacer les boîtes les unes dans les autres, par "cliquer-glisser" avec la souris, en sorte que chaque espèce n'apparaisse qu'une seule fois. Appeler le Professeur pour vérification.

Piste d'exploitation

Intégrer une copie d'écran des groupes emboîtés dans votre compte rendu en cliquant le bouton "Copier / Copier le diagramme (boîtes)".

Construction d'un arbre phylogénétique

On peut représenter d'une autre façon les groupes d'êtres vivants, sous la forme d'un arbre (arbre de parenté ou arbre phylogénétique).

Choisir le menu "Activités / Établir les parentés". Cliquer sur "oui" dans la fenêtre de dialogue qui apparaît.
Faire apparaître l'arbre en cliquant sur les caractères de la matrice.
Faire apparaître les boîtes sur l'arbre en cliquant sur le bouton "Choix" en bas de l'arbre et en sélectionnant successivement "Afficher les boîtes de l'arbre" et "Afficher les noms de groupes".

Certains groupes n'ont pas de nom. Vous aller leur en donner un en fonction des caractères propres au groupe.

Faire un double clic sur "Groupe non nommé" puis choisir "Nommer le groupe" dans la fenêtre "Caractères".
Choisir un nom au groupe en cliquant dessus. S'aider des informations.
Recommencer avec les autres groupes non nommés. Appeler le Professeur pour vérification

Pistes d'exploitation

Intégrer une copie d'écran de l'arbre phylogénétique dans votre compte rendu en cliquant le bouton "Copier / Copier l'arbre… / …tel quel".
Dans quelle(s) boîte(s) se trouve l'espèce humaine ? Qu'est-ce-que cela signifie sur notre espèce ?

Document 2 - Données génétiques

Construction d'une matrice et d'un arbre phylogénétique

Ouvrir le logiciel Anagène en ligne (utilisateur : tes, mot de passe : darwin).
Sélectionner les cinq séquences de la NAD proposées.
Comparer les séquences, construire une matrice des ressemblances puis un arbre phylogénétique.