9-La biodiversité et son évolution

Dossier 1 - Estimer la richesse spécifique d'une population

Pour estimer la biodiversité, on peut évaluer le nombre d'espèces.

Source : www.kidsnews.com.au

Notions évoquées dans ce dossier
  • une espèce
  • la biodiversité
  • la richesse spécifique

Document 1 - Méthode des quadrats

Document 2 - Analyse métagénomique

Principe

Source : Le livre scolaire (document 3 page 173)

Source : Nathan (page 212)

Source : Nathan (page 213)

Application

On cherche à identifier trois êtres vivants. On ne connait de chacun d'eux qu'une séquence d'ADN, récupérée au cours de l'expédition TARA.

Étapes

  1. Ouvrir le logiciel BLAST.
  2. Sélectionner « Nucleotide BLAST » (Blast de fragment d’ADN).
  3. Copier/coller la séquence d’ADN n°1 dans le cadre « Enter Query sequence ».
  4. Cliquer sur le bouton « BLAST ».
  5. Noter le nom du taxon identifié plus de 85% (on considère que c'est suffisant pour une détermination).
  6. Recommencer avec les deux autres séquences.

Pistes d'exploitation

  1. Comparer les deux méthodes de détermination de la richesse spécifique (par la morphologie, par l'ADN).
  2. Citer quelques facteurs pouvant modifier la richesse spécifique à un endroit donné.
Questions pour "spécialistes"
Une analyse plus fine des résultats de l'expédition TARA
  1. À partir des données, construire un diagramme représentant l'abondance relative en Diatomées des sites échantillonnés par l'expédition TARA.
  2. Identifier le(s) facteur(s) pouvant modifier la richesse spécifique d'un écosystème.
Aide : exploitation des données

Pour savoir si un facteur peut "modifier la richesse spécifique d'un écosystème", il faut essayer de mettre en évidence une corrélation entre ce facteur (supposé) et la richesse spécifique (= biodiversité).

Pour cela, on peut représenter graphiquement la variation de la biodiversité en fonction du facteur.

Le plus simple est de créer un "tableau croisé dynamique" et de sélectionner le(s) facteur(s) supposé(s) ainsi que la colonne représentant la biodiversité.

Source : Lydia Provin

Source : Analyse de données de l’expédition Tara Océans (2009-2012)