Une nouvelle espèce d'Hominidé, Homo denisovensis, a été définie après la découverte de quelques restes fossiles dans une grotte en Russie, car les données génétiques ont montré qu'il ne s'agissait ni d'Homo sapiens, ni d'Homo neanderthalensis.
- De qui les dénisoviens sont-ils les plus proches : des humains actuels ou des néanderthaliens ?
Homo sapiens est l'humain actuel, Homo neanderthalensis est "l'Homme de Néanderthal", les Hominidés sont les grands singes (orang-outans, gorilles, chimpanzés et humains).
Notions évoquées dans ce dossier
- la paléogénétique
- la PCR
- le séquençage de l'ADN
- une matrice des distances
- un arbre phylogénétique
Source (Homme de Néanderthal : Keystone/Science Photo Library Spl/S. Entressangle/E. Daynes)
Document 2.1 - Les méthodes de la paléogénétique
Source : Pour la Science n° 506, décembre 2019 |
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Document 2.2 - Données génétiques
Le gène de chimpanzé sert d' "extra-groupe", une sorte de "témoin" qui permet d' "enraciner" l'arbre phylogénétique.
Étapes
Avec Anagène (utiliser GenieGen2 en cas de problème)
- Ouvrir le logiciel Anagène en ligne (1S-gen puis mendel).
- Sélectionner toutes les séquences du dossier "Niveaux / 02 Première spé SvT / L'histoire humaine lue dans son génome / Phylogénie du genre homo / ADN mitochondrial complet".
- Comparer les séquences.
- Dans la fenêtre de comparaison, basculer sur l'onglet "arbre phylogénétique".
- Compléter la matrice des distances avec les informations fournies.
- Construire l'arbre phylogénétique.
Avec Geniegen2
- Ouvrir le logiciel GenieGen2 en ligne.
- Ouvrir et charger la banque de séquences "ADN mitochondrial (complet) comparaison sapiens, neanderthalensis et denisova".
- Comparer les séquences (menu "Actions/Aligner les séquence sélectionnées").
Les séquences sont longues, la comparaison peut durer plusieurs minutes…
- Le menu "Affichage" vous permet d'"Afficher le tableau de comparaison" (encore appelé "matrice des différences" ou "des similitudes" selon l'option choisie).
- Le même menu vous permet d'"Afficher le phénogramme" (encore appelé "arbre phylogénétique").
Pistes d'exploitation
- Résumer les méthodes de la paléogénétique.
- Intégrer la matrice des distances et l'arbre phylogénétique dans le compte rendu, en précisant ce qu'ils représentent.
- Répondre à la question en exploitant les documents (dont la matrice et l'arbre).
- Éléments de réponse (matrice des distances et arbre phylogénétique)