- Aller sur l'atlas des protéines.
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C'est une base de données sur les protéines humaines, leur localisation, leur gènes… |
- Choisir "Metabolic atlas" puis "Cellular compartment".
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Le diagramme représente les voies métaboliques cellulaires, c'est-à-dire les réactions chimiques qui s'y déroule et leurs connexions. Il y en a… beaucoup ! |
- Choisir "Starch and sucrose metabolism" dans "Subsystems".
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Le diagramme représente les voies métaboliques aboutissant ou partant de l'amidon et d'autres glucides, dans le cytosol et la matrice extracellulaire.
- cytosol (le) : partie liquide du cytoplasme (c'est-à-dire le cytoplasme "moins" les organites)
- lien de secours
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- Ouvrir le panneau "data overlay" à droite puis sélectionner "liver" (foie) dans le menu déroulant "data 1".
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La carte représente par une gamme de couleurs l'intensité de l'expression des différents gènes des voies métaboliques. Ces gènes sont représentés dans les rectangles : il suffit de cliquer sur l'un d'eux pour avoir des informations sur le gène…
L'expression d'un gène est mesurée par la quantité d'ARNm produit. |
- Sélectionner "cerebral cortex" (cerveau) dans le menu déroulant "data 1".
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On voit que les cellules hépatiques et les cellules nerveuses n'expriment pas les mêmes gènes, ou pas avec la même intensité. |
- Sélectionner "liver" (foie) dans le menu déroulant "data 2".
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La gamme de couleur représente maintenant la différence d'expression génique entre les deux types de cellules. Un gène en bleu est moins exprimé dans le foie (data 2) que dans le cerveau (data 1), et inversement pour un gène représenté en rouge. |
